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MÉTHODES D'IDENTIFICATION ET D'UTILISATION DE PRÉDICTEURS DE PETITS ARN
专利权人:
INC.;SRNALYTICS
发明人:
SALZMAN, David
申请号:
USUS2018/014856
公开号:
WO2018/136936A1
申请日:
2018.01.23
申请国别(地区):
US
年份:
2018
代理人:
摘要:
The invention provides a method for identifying or detecting small RNA (sRNA) predictors of a disease or a condition. The method comprises identifying one or more sRNA sequences that are present in one or more samples of an experimental cohort, and which are not present across a comparator cohort; and optionally identifying one or more sRNA sequences that are present in one or more samples of a comparator cohort, and which are not present across an experimental cohort. In contrast to identifying dysregulated non-coding RNAs (such as miRs that are up- or down-regulated), the invention identifies sRNAs that are binary predictors, that is, present in one cohort (e.g., an experimental cohort) and not another (e.g., a comparator cohort). Further, by quantifying reads for individual sequences (e.g., iso-miRs), without consolidating reads to annotated reference sequences, the invention unlocks the diagnostic utility of miRs and other sRNAs.L'invention concerne une méthode d'identification ou de détection de prédicteurs de petits ARN (pARN) d'une maladie ou d'une affection. La méthode consiste à identifier une ou plusieurs séquences de pARN qui sont présentes dans un ou plusieurs échantillons d'une cohorte expérimentale, et qui ne sont pas présentes dans une cohorte comparative; et éventuellement à identifier une ou plusieurs séquences de pARN qui sont présentes dans un ou plusieurs échantillons d'une cohorte comparative, et qui ne sont pas présentes dans une cohorte expérimentale. Contrairement à l'identification d'ARN non codants dérégulés (tels que des miR qui sont régulés à la hausse ou à la baisse), l'invention permet d'identifier des pARN qui sont des prédicteurs binaires, à savoir présents dans une cohorte (par exemple, une cohorte expérimentale) et non dans une autre (par exemple, une cohorte comparative). En outre, en quantifiant des lectures de séquences individuelles (par exemple, iso-miR), sans consolidation des lectures par rapport à des séquences de référence
来源网站:
中国工程科技知识中心
来源网址:
http://www.ckcest.cn/home/

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