本发明提供一种靶向GATM基因的sgRNA及其应用,GATM基因活性增强子为靶向人GATM基因启动子上游的远程增强子E1~E6,其完整的核苷酸序列分别为:如SEQ ID NO.1、如SEQ ID NO.2、如SEQ ID NO.3、如SEQ ID NO.4、如SEQ ID NO.5、如SEQ ID NO.6所示的序列及其反向互补序列。GATM基因编辑工具包括dCas9与抑制因子的融合蛋白、上述sgRNA和载体。本发明鉴定了导致胰腺癌细胞转移的特异性基因GATM及其所属的远程增强子调控元件,靶向GATM基因的增强子能够在不影响GATM基因结构及蛋白结构的前提下,更加特异性地抑制胰腺癌细胞的迁移活动,从而更加精准地达到治疗胰腺癌转移的目的。