本发明公开了‘湖北海棠’MhWRKY40a基因及其应用。‘湖北海棠’MhWRKY40a基因,核苷酸序列如SEQ ID NO.1。所述的MhWRKY40a基因在创制耐盐和抗低温新种质和/或植物品种改良中的应用。本发明首次从‘湖北海棠’克隆得到了一个新的MhWRKY40a基因,该基因序列与拟南芥、葡萄及大麦之间的同源性为50.89%。但MhWRKY40a基因蛋白三级结构与模式植物拟南芥上的同源基因明显不同,前者具5个β折叠而后者具4个β折叠。MhWRKY40a转基因烟草具有较强的耐盐和抵御低温胁迫的能力,并提高了抗性相关基因的表达,说明MhWRKY40a基因具有提高植物耐盐和抗寒的功能。