In a first aspect, a sampling device for collecting a microbiota sample from a gastrointestinal system configured to passively control the communication between an inside and an outside of the sampling device is provided. In a further aspect, a sampling device for collecting a microbiota sample from a gastrointestinal system configured to deliver an aqueous medium is provided. In yet a further aspect, a method for collecting a microbiota sample from a gastrointestinal system is provided.Selon un premier aspect, l'invention concerne un dispositif d'échantillonnage pour collecter un échantillon de microbiote d'un système gastro-intestinal conçu pour contrôler passivement la communication entre un intérieur et un extérieur du dispositif d'échantillonnage. Dans un autre aspect, l'invention concerne un dispositif d'échantillonnage pour collecter un échantillon de microbiote à partir d'un système gastro-intestinal conçu pour administrer un milieu aqueux. Dans encore un autre aspect, l'invention concerne un procédé de collecte d'un échantillon de microbiote à partir d'un système gastro-intestinal.
