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一种海岛棉EST-SSR标记的制备方法及应用
- 专利权人:
- 华中农业大学
- 发明人:
- 张献龙,林忠旭,张艳欣,涂礼莉,聂以春
- 申请号:
- CN200610166552.5
- 公开号:
- CN101020924A
- 申请日:
- 2006.12.30
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2007
- 代理人:
- 王敏锋
- 摘要:
- 本发明属于棉花育种领域,涉及一种海岛棉EST-SSR引物序列的制备技术及应用,利用这些引物进行棉花遗传多样性的评价、分子遗传连锁构建和棉花重要性状的QTL定位。步骤包括:1)建立海岛棉品系Pima3-79纤维发育的cDNA文库,从单一序列中挑出占其中富含二、三、四、五或六核苷酸重复且长度≥10碱基的EST;2)设计SSR侧翼引物;3)从田间取基因型为AA、DD和AADD的棉种材料和亲本鄂棉22、Pima3-79以及BC1群体植株的嫩绿叶片提取其总DNA;4)用设计的SSR引物扩增步骤3)所示的材料和群体;5)计算每对引物的多态性信息含量,并对步骤3)所示的基因型棉种材料作聚类和主坐标分析;6)将BC1作图群体扩增的EST-SSR整合到种间遗传连锁图谱相应的连锁群上,并作棉花重要性状的QTL定位。结果显示,位于连锁群15的引物HAU033与籽指性状连锁,位于连锁群29的引物HAU100与单株铃数性状连锁;分别贡献了表型变异的7.41%和5.95%。
- 来源网站:
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址:
- http://www.ckcest.cn/home/