Inserting portion (21), the insertion part imaging section which acquires an image of a plurality of sheets by chronologically imaging an optical image of the object by the objective optical system (24) provided at the distal end portion (21) (25 ), a channel which is open at the distal end of the insertion portion (21) (26), and an endoscope having a (2), and a laser probe is inserted into the channel (26) (5), the laser probe for each image (5) an image analyzing section that detects an image portion (33), the time series continuous to the plurality of image portions on the basis of the detected result the laser probe of a laser probe (5) to the image (5) of the channel (26 The endoscope system including the control unit for permitting the laser output only when it is determined that protrudes from the opening (35), a) (1).挿入部(21)と、挿入部(21)の先端部に設けられた対物光学系(24)による被検体の光学像を時系列的に撮像して複数枚の画像を取得する撮像部(25)と、挿入部(21)の先端部に開口するチャンネル(26)と、を有する内視鏡(2)と、チャンネル(26)に挿通されるレーザプローブ(5)と、各画像についてレーザプローブ(5)の画像部分を検出する画像解析部(33)と、時系列的に連続する複数枚の画像に対するレーザプローブ(5)の画像部分の検出結果に基づきレーザプローブ(5)がチャンネル(26)の開口から突出したと判定した場合にのみレーザ出力を許可する制御部(35)と、を備えた内視鏡システム(1)。