To provide an imaging system, a control device, a control method, and a control program capable of obtaining an image with appropriate brightness regardless of the type of light source. An endoscope system 1 according to the present invention includes an imaging element 22 having an electronic shutter function, an endoscope 2 that images a subject, a first light source 351 that emits illumination light for illuminating the subject, and The second light source 52 of the external light source device 5, the light source identification unit 371 that identifies the type of light source used for observation, and the image sensor 22 based on the control pattern corresponding to the type of light source identified by the light source identification unit 371. An electronic shutter control unit 375 for controlling the electronic shutter function.光源の種別によらず、適切な明るさの画像を得ることができる撮像システム、制御装置、制御方法及び制御プログラムを提供すること。本発明に係る内視鏡システム１は、電子シャッター機能を備える撮像素子２２を備え、被検体を撮像する内視鏡２と、被検体を照明するための照明光を出射する第１光源３５１及び外部光源装置５の第２光源５２と、観察に使用される光源の種別を識別する光源識別部３７１と、光源識別部３７１が識別した光源の種別に応じた制御パターンに基づいて撮像素子２２の電子シャッター機能を制御する電子シャッター制御部３７５と、を備える。
