The present invention provides methods for enhancing or inducing airway epithelial repair and/or regeneration and/or for the normalization of airway epithelial remodeling, using local deposition of one or more pro-regenerative factors, preferably a peptide or protein from the trefoil family factor (TFF) family. The pro-regenerative factor is administered to a patient as a treatment of Chronic obstructive pulmonary disease (COPD), chronic bronchitis, Cystic fibrosis, Asthma, Bronchiectasis, Panbronchiolitis, pneumonia, ventilator associated pneumonia (VAP), hospital acquired pneumonia (HAP), community acquired pneumonia (CAP), severe community acquired pneumonia (sCAP) and pneumocystis carinii or to patients suffering from lung damage reducing the function of the mucociliary transport system based on fully functioning cilia secondary to, e.g. inhalation of toxic fumes. The present invention also provide therapy and or prophylactic or preemptive, i.e. prophylaxis based on a predefined group of patients like intervention in smokers in order to enhance ongoing airway epithelial repair and/or regeneration of the airways cilia improving the mucociliary clearance. The pro-regenerative factor is administered intratracheal, intrabronchial, intraalveolar or broncioalveolar. Administration for example via inhalation of an aerosol or as a dry powder and/or administered as a bronchoalveolar lavage (BAL) an effective amount of the agent.本発明は、１種以上の再生促進因子、好ましくはトレフォイルファミリー因子（ＴＦＦ）ファミリー由来のペプチドもしくはタンパク質の局所沈着を用いた、気道上皮の修復および／もしくは再生を増強もしくは誘導するための方法、ならびに／または気道上皮のリモデリングの正常化のための方法を提供する。再生促進因子は、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、慢性気管支炎、嚢胞性線維症、喘息、気管支拡張、汎細気管支炎、肺炎、人工呼吸器関連肺炎（ＶＡＰ）、院内感染性肺炎（ＨＡＰ）、市中感染性肺炎（ＣＡＰ）、重症市中感染性肺炎（ｓＣＡＰ）およびカリニ肺炎菌の治療薬として患者に投与されるか、または、例えば有毒ガスの吸入による、完全に機能している繊毛に対して粘膜繊毛輸送系の機能を低下させる肺損傷を患う患者に投与される。本発明はまた、進行中の気道上皮の修復および／または気道繊毛の再生を増強させ、粘膜繊毛クリアランスを改善するための、治療およびまたは予防的なもしくは先制の、すなわち喫煙者における介入などあらかじめ定められた患者群に基づいた予防法を提供する。再生促進因子は、気管内、気管支内、肺胞内または気管支肺胞に投与される。例えば、エアロゾルもしくは乾燥粉末の吸入により、および／または気管支肺胞洗浄（ＢＡＬ）として、有効量の薬剤が投与さ
