Particular disclosed embodiments disclosed herein concern using a one or more various mass tags, which can be specifically deposited at targets through direct or indirect enzymatic-catalyzed transformation, to provide a method for identifying targets in tissue samples. The mass tags may be labeled with stable isotopes to produce mass tags having the same chemical structure but different masses. Mass codes produced by ionizing the mass tags are detected and/or quantified using mass spectrometry. The method can be used for multiplexed detection of multiple targets in a particular sample. In some embodiments, a map divided into sections representing sections of the tissue sample may be prepared, with the map sections including data corresponding to quantification data wherein the size of a mass peak is determined and correlated with the amount of a target for the corresponding tissue sample section.La présente invention se rapporte, dans des modes de réalisation particuliers, à lutilisation dun ou plusieurs différents marqueurs de masse qui peuvent être déposés de façon précise sur des matières cibles au moyen dune transformation directe ou indirecte catalysée par des enzymes, pour donner un procédé permettant didentifier des matières cibles dans des échantillons tissulaires. Les marqueurs de masse peuvent être marqués avec des isotopes stables afin dobtenir des marqueurs de masse qui ont la même structure chimique mais des masses différentes. Des codes de masse produits par ionisation des marqueurs de masse sont détectés et/ou quantifiés à laide dune spectrométrie de masse. Le procédé peut être utilisé pour permettre une détection multiplexée de multiples matières cibles dans un échantillon particulier. Selon certains modes de réalisation, une carte divisée en plusieurs sections qui représentent des sections de léchantillon tissulaire peut être préparée, les sections de carte comportant des données qui correspondent à des données de quantification, la taille dun pic d