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采用觅食机制的人工蜂群优化算法识别关键蛋白质的方法
- 专利权人:
- 陕西师范大学
- 发明人:
- 雷秀娟,丁玉连,陆铖,代才,程适
- 申请号:
- CN201710050587.0
- 公开号:
- CN106874708B
- 申请日:
- 2017.01.23
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2018
- 代理人:
- 强宏超
- 摘要:
- 本发明公开了一种采用觅食机制的人工蜂群优化算法识别关键蛋白质的方法,将蛋白质相互作用网络转化为无向图、获取蛋白质对应的核糖核酸基因表达值、对蛋白质相互作用网络边和结点预处理、构建动态蛋白质相互作用网络、选取已知关键蛋白质作为蜜源、采蜜蜂搜索蜜源邻域、跟随蜂搜索采蜜蜂邻域、更新蜜源、侦查蜂全局搜索新蜜源、更新蜜源、产生关键蛋白质。本发明方法能准确地识别关键蛋白质;仿真实验结果表明,敏感度、特异性、阳性预测值、阴性预测值等指标性能较优;与其他关键蛋白识别方法相比,结合人工蜂群的优化特性与蛋白质相互作用网络的特征实现关键蛋白质的识别过程,提高了关键蛋白质的识别准确率。
- 来源网站:
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址:
- http://www.ckcest.cn/home/