A method of operating a closed photobioreactor for cultivation of phototrophic microorganisms. The photobioreactor comprises a culture liquid and is partially or completely surrounded by water of a water body. A density difference between the culture liquid and the surrounding water is provided so that the position of the photobioreactor in the water body is controlled. A closed photobioreactor for cultivation of phototrophic microorganisms. The photobioreactor is adapted to comprise a culture liquid and to be partially or completely surrounded by water of a water body. The photobioreactor comprises means for determining the density difference between the culture liquid and the surrounding waterИзобретение касается способа эксплуатации закрытого фотобиореактора для культивирования фототрофных микроорганизмов, который содержит культуральную жидкость и частично или полностью окружен водой водоема. В способе по изобретению обеспечивают разность плотностей культуральной жидкости и окружающей воды, так чтобы управлять положением фотобиореактора в водоеме. Изобретение также касается закрытого фотобиореактора для культивирования фототрофных микроорганизмов, приспособленного для содержания культуральной жидкости и для того, чтобы быть частично или полностью окруженным водой водоема. Фотобиореактор содержит средства определения разности плотностей культуральной жидкости и окружающей воды.