PURPOSE: An agent for preventing plant disease using mixture strain of Bacillus subtilis M27 and 5M34 is provided to suppress occurrence of vegetable sclerotial rot and to ensure stability of fresh vegetables. CONSTITUTION: A Bacillus subtilis 5M34 (deposit number KACC 91488P) prevents plant pathogen. A microorganism formulation for preventing plant pathogen contains Bacillus subtilis 5M34(deposit number KACC 91488P) and Bacillus subtilis M27(deposit number KACC 91208P). The plant pathogens are Sclerotinia sclerotiorum, Sclerotium cepivorum, Sclerotinia minor, Sclerotium rolfisii, hizoctonia solani, Botrytis cinerea, Fusarium oxysporum, Didymella bryoniae, Alternaria solani, Corynespora cassiicola, Colletotrichum gloeosporioides, Colletotrichum acutatum, or Phytophotra capsici.본 발명은 국내 부존자원인 유용미생물을 분리, 선발, 이용하여 채소 균핵병의 발생을 억제함으로써 생식 신선채소의 안정적 생산을 도모하고, 안전하고 품질이 좋은 농산물 생산기술에 기여하고자 여러 가지 식물 병원균을 방제할 수 있는 신규 바실러스 서브틸리스 5M34(기탁번호 KACC 91488P)를 분리, 선발하였고 이를 이용한 식물 병원균을 방제하는 방법을 제공한다. 또한 발명한 바실러스 서브틸리스 5M34 균주는 균핵병균(Sclerotinia sclerotiorum, Sclerotinia minor)의 균사생육 및 균핵의 발아를 억제하였으며, 온실에서도 상추재배 중 발생초기에 처리할 경우 병 발생을 60%, 그리고 바실러스 서브틸리스 M27(KACC 91208P)와 혼합처리에서 86.6%까지 현저히 억제한다. 따라서 본 발명은 식물병원균에 대한 생물농약으로 기능할 수 있어 잔류농약으로 인한 문제점을 방지할 수 있으며, 환경에 대한 해가 없으며, 농업 생태계 보전과 병해종합관리를 위한 획기적인 생물학적 방제방법을 제공한다.