PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a processor device capable of leaving information on the reliability of oxygen saturation, an operation method thereof, and an endoscope system so that an oxygen saturation image can be verified. An oxygen saturation calculation unit 70 calculates an oxygen saturation of an observation target based on a plurality of spectroscopic images. The reliability calculation unit 72 calculates the reliability of oxygen saturation based on a plurality of spectral images. When a still image acquisition instruction is given by the freeze switch 13b, the image creation unit 73 creates an oxygen saturation image based on the oxygen saturation and reliability, and a reliability image that images the distribution of reliability. The still image storage control unit 64 stores the still image of the oxygen saturation image and the reliability image in the still image storage unit 65. [Selection diagram] FIG. 14【課題】酸素飽和度画像を検証できるようにするために、酸素飽和度の信頼度に関する情報を残すことができるプロセッサ装置及びその作動方法並びに内視鏡システムを提供する。【解決手段】酸素飽和度算出部７０は、複数の分光画像に基づいて、観察対象の酸素飽和度を算出する。信頼度算出部７２は、複数の分光画像に基づいて、酸素飽和度の信頼度を算出する。フリーズスイッチ１３ｂにより静止画取得指示が行われた場合に、画像作成部７３が、酸素飽和度及び信頼度に基づく酸素飽和度画像、及び、信頼度の分布を画像化した信頼度画像を作成し、静止画保存制御部６４が、酸素飽和度画像の静止画、及び信頼度画像を静止画保存部６５に保存する。【選択図】図１４
