A method of identifying and producing immune stimulating microbial strains in fish to prevent pathogenic microorganisms, because it involves the following stages: isolation of microorganisms from the digestive tract of healthy animals; isolation of genetic characteristics of microorganisms; characterization of pathogenic microorganisms. Complementary philanthropic properties; Determination of immune stimulating capacity in the axenics model; and production of antibiotics; and their use in the prevention of susceptible bacteria in Salmonella.Un método para identificar y producir cepas microbiológicas con capacidad inmuno-estimulante en peces para la defensa frente a microorganismos patógenos, porque comprende las etapas de:aislamiento de los microorganismos desde el tracto digestivo de hospederos sanos; caracterización genética de los microorganismos aislados; caracterización de las propiedades benéficas complementarias; identificación de la capacidad inmuno-estimulante en modelos axénicos; y producción de los probióticos; y su uso en profilaxis contra flavobacteriosis en salmónidos.