The present invention has a core-shell multi-structure comprising: a core comprising at least one inorganic selected from a group consisting of iodine, zirconium, tantalum, barium, strontium, palladium, tin, rhodium, iridium, manganese, and molybdenum or compounds thereof; and a shell comprising a coating layer containing at least one or more biocompatible polymers on the outside of the core. More specifically, the present invention relates to: an implantable microparticle which can track a location of microparticles by entering the same into the body and using X-ray medical devices, has excellent elasticity that makes it easy to block blood vessels of various diameters, and can prevent the introduction of the inorganic material in the body by multi-coating an inorganic material with a biocompatible polymer, thereby being safe; and a manufacturing method thereof.COPYRIGHT KIPO 2020본 발명은 아이오딘, 지르코늄, 탄탈륨, 바륨, 스트론튬, 팔라듐, 주석, 로듐, 이리듐, 망간 및 몰리브덴 또는 이들의 화합물로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 무기물을 포함하는 코어; 및 상기 코어의 외측에 적어도 1층 이상의 생체적합성 고분자를 함유하는 코팅층을 포함하는 쉘;을 함유하는 코어-쉘 다중구조인 것을 특징으로 함으로써, 체내 투입 후 X-선 의료기기를 이용하여 미립자의 위치를 추적할 수 있으며, 탄력성이 우수하여 다양한 직경의 혈관 폐색에 용이할 뿐만 아니라, 무기물을 생체적합성 고분자로 다중코팅 함으로써, 상기 무기물의 체내 유입을 방지하여 안전한 체내 삽입형 미립자 및 이의 제조방법에 대한 것이다.