本发明公开了调控玉米叶夹角的DNA序列及其突变体、分子标记、检测引物和应用。本发明首先提供了调控玉米叶夹角的关键DNA序列及其突变体,其多核苷酸序列为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示,本发明所提供的调控玉米叶夹角的DNA序列及其突变体能够调控ZmNAC16基因在玉米叶枕中的表达,进而应用于改良玉米叶夹角和株型,也可进一步应用于培育玉米新品种。本发明还进一步提供了DNA关键序列及其突变体变异情况的特异性检测引物以及检测玉米中ZmNAC16基因表达量的检测引物,这些检测引物能应用于定向改良玉米的叶夹角,对于玉米耐密植和高产量育种也具有应用潜力。