本发明涉及一个来自“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢参与嘧啶核苷酸出发合成代谢嘧啶的5’-核苷酸酶,编码基因及其应用,所述酶氨基酸序列具有SEQ ID No.1所示序列90%以上同源性,其编码基因具有SEQ ID No.2所示的核苷酸序列90%以上同源性;本发明从原理上对嘧啶核苷酸合成嘧啶的代谢途径进行了详细研究,包含本发明所提供的核苷酸序列的克隆DNA可以用来通过转导、转化、结合转移的方法转入工程菌中,通过调节嘧啶生物合成基因的表达,赋予宿主嘧啶的高表达性,为扩大嘧啶的产量提供了有效途径,具有重大应用前景。