本发明涉及一个来自“百令”生产菌冬虫夏草中国被毛孢参与嘧啶核苷酸出发合成代谢二磷酸嘧啶核苷的酶,编码这个酶的基因及其应用,所述酶即为尿苷酸-胞苷酸激酶,所述酶具有SEQ ID No.1所示的核苷酸序列90%以上同源性,其编码基因具有SEQ ID No.2所示的核苷酸序列90%以上同源性。本发明从原理上对嘧啶核苷酸合成二磷酸嘧啶核苷的代谢途径进行了详细研究,包含本发明所提供的核苷酸序列的克隆DNA可以用来通过转导、转化、结合转移的方法转入工程菌中,通过调节二磷酸嘧啶核苷生物合成基因的表达,赋予宿主二磷酸嘧啶核苷的高表达性,为扩大二磷酸嘧啶核苷的产量提供了有效途径,具有重大应用前景。