PURPOSE: A microorganism formulation using a strain is provided to improve antibacterial function against pest and to suppress plant pathogen growth. CONSTITUTION: A plant pathogen antagonistic strain, Bacillus subtilis GDYA-1(deposit number KFCC 11505P) has an antibacterial activity against bacterial blight, leaf blast, bakanae disease, bacterial grain rot, and seeding blight. The strain has an amino acid of sequence number 1. A microorganism formulation for preventing plant pathogen contains the strain, of a culture medium, or a mixture thereof as an active ingredient.본 발명은 식물 병해에 길항성을 지닌 미생물 균주와 이를 제제화시킨 미생물 제제에 관한 것으로, 흰잎마름병, 도열병, 키다리병, 벼알마름병, 깨씨무늬병, 잎집무늬마름병 등의 수도작의 주요 병해를 방제할 수 있는 식물 병원균 길항 균주 바실러스 서브틸리스 GDYA-1(기탁번호 KFCC 11505P) 및 식물 병원균 길항 균주 바실러스 서브틸리스 GDYA-1(기탁번호 KFCC 11505P) 또는 그의 배양액 또는 이들의 혼합물을 유효성분으로 포함하는 식물 병원균 방제용 미생물 제제를 제공한다.본 발명의 식물 병원균 길항 균주 바실러스 서브틸리스 GDYA-1(기탁번호 KFCC 11505P) 또는 이를 이용한 미생물 제제는 흰잎마름병, 도열병, 키다리병, 벼알마름병, 깨씨무늬병, 잎집무늬마름병 등의 수도작의 주요 병해에 대해 항균 활성을 나타내어 다양한 식물 병원균의 생육을 저지함으로써 각종 농작물의 병해 발병률을 크게 감소시키는 친환경 미생물 농약을 제공할 수 있다.