PROBLEM TO BE SOLVED: To design and select a high-resolution crystal structure of a human 4-phosphate adapter protein 2 glycolipid transfer protein-like domain, a method of use in drug discovery, and a compound which binds to phosphoinositol 4-phosphate adapter protein-2 (FAPP2). Methods for and / or optimization are also provided. I will provide a. A method for identifying a compound that binds to FAPP2 includes a step of computer-identifying a compound that binds to FAPP2 using the atomic coordinates of at least the amino acids that make up the substrate binding pocket of FAPP2. [Selection diagram] Fig. 1【課題】ヒト４－リン酸アダプタータンパク質２糖脂質移行タンパク質様ドメインの高分解能結晶構造及び創薬における使用方法並びにホスホイノシトール４－リン酸アダプタータンパク質－２（ＦＡＰＰ２）に結合する化合物を設計、選択および／または最適化する方法も提供される。を提供する。【解決手段】ＦＡＰＰ２に結合する化合物を同定する方法において、、ＦＡＰＰ２の基質結合ポケットを構成する少なくともアミノ酸の原子座標を使用して、ＦＡＰＰ２に結合する化合物をコンピューターで同定するステップとを含む。【選択図】図１
