本发明提供了一种鸡皮肤颜色相关的分子标记,该分子标记是位于SEQ IDNO:1所示序列中的第259位碱基处的A/G碱基突变。本发明还提供了该分子标记的鉴别方法及其在鸡皮肤颜色性状方面的分子标记辅助选择中的应用。该分子标记是以鸡BCDO2基因的DNA序列为模板,选择SEQ ID NO:2和SEQ IDNO:3所示的引物进行扩增。本发明所使用的检测方法准确性高、成本低。通过对上述A/G突变位点的检测,能知道目标鸡群皮肤颜色这一性状的基因型,从而能有目的对鸡群进行选择,提高其后代鸡群皮肤颜色及胫色的一致性。