The present invention relates to production of polyketides and other natural products and to libraries of compounds and individual novel compounds. One important area is the isolation and potential use of novel FKBP-ligand analogues and host cells that produce these compounds. The invention is particularly concerned with methods for the efficient transformation of strains that produce FKBP analogues and recombinant cells in which cloned genes or gene cassettes are expressed to generate novel compounds such as polyketide (especially rapamycin) FKBP-ligand analogues, and to processes for their preparation, and to means employed therein (e.g. nucleic acids, vectors, gene cassettes and genetically modified strains).la présente invention concerne la production de polykétides et autres produits naturels ainsi que des banques de composés et des composés individuels nouveaux. Un aspect important concerne lisolement et lutilisation potentielle de nouveaux analogues de ligand FKBP et des cellules hôtes qui produisent ces composés. Linvention concerne en particulier des méthodes de transformation efficace de souches produisant des analogues de FKBP et des cellules de recombinaison dans lesquelles des gènes clonés ou des cassettes de gènes sont exprimés et produisent des nouveaux composés tels que des analogues de ligand polyketidiques (en particulier la rapamycine) et leurs méthodes de préparation et moyens utilisés (tels quacides nucléiques, vecteurs, cassettes de gènes et souches génétiquement modifiées).