A computing device, method, system, and instructions in a non-transitory computer-readable medium for performing image analysis on 3D microscopy images to predict localization and/or labeling of various structures or objects of interest, by predicting the location in such images at which a dye or other marker associated with such structures would appear. The computing device, method, and system receives sets of 3D images that include unlabeled images, such as transmitted light images or electron microscope images, and labeled images, such as images captured with fluorescence tagging. The computing device trains a statistical model to associate structures in the labeled images with the same structures in the unlabeled light images. The processor further applies the statistical model to a new unlabeled image to generate a predictive labeled image that predicts the location of a structure of interest in the new image.La présente invention concerne un dispositif informatique, un procédé, un système et des instructions dans un support lisible par ordinateur non transitoire pour effectuer une analyse d'image sur des images de microscopie 3D afin de prédire la localisation et/ou le marquage de diverses structures ou de divers objets d'intérêt, par prédiction de l'emplacement dans de telles images où un colorant ou un autre marqueur associé à ces structures apparaît. Le dispositif informatique, le procédé et le système reçoivent des ensembles d'images 3D qui comprennent des images non marquées, telles que des images de lumière transmise ou des images de microscope électronique, et des images marquées, telles que des images capturées avec un marquage par fluorescence. Le dispositif informatique entraîne un modèle statistique pour associer des structures dans les images marquées aux mêmes structures dans les images de lumière non marquées. Le processeur applique en outre le modèle statistique à une nouvelle image non marquée pour générer une image marquée prédictive qui prédi