本发明公开了一种植物谷蛋白分选相关蛋白OsGPA5及其编码基因与应用。本发明通过水稻谷蛋白分选突变体gpa5的表型分析和目标基因的初步定位,最终克隆得到谷蛋白分选相关蛋白OsGPA5,该相关蛋白由SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列组成,或将SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且仍具有谷蛋白分选相关的由序列SEQ ID NO.1衍生的蛋白质。本发明的谷蛋白分选相关蛋白影响水稻胚乳中谷蛋白的分选过程,将所述蛋白的编码基因导入成熟谷蛋白含量降低的植物中,可以得到成熟谷蛋白含量正常的转基因植物,因此,本发明所述蛋白及其编码基因可以应用于植物遗传改良。