The present invention provides a pharmaceutical composition for preventing or treating gastrointestinal motility disorders and gastrointestinal motility disorders comprising at least two combinations selected from the group consisting of Bupleuri Radix, Coptidis Rhizoma and Glycyrrhizae Radix et Rhizoma. It provides a health functional food composition for the prevention or improvement of. The composition according to the invention comprises a combination of two or more of shiho, rhubarb and licorice, and significantly promotes the exercise of the gastrointestinal tract, in particular gastric emptying rate and intestinal transport capacity, It is useful for the prevention, amelioration or treatment of related functional dyspepsia. In addition, the composition according to the present invention is preferably made of a natural material because there is little toxicity to the human body.본 발명은 시호(Bupleuri Radix), 황련(Coptidis Rhizoma) 및 감초(Glycyrrhizae Radix et Rhizoma)로 이루어진 군에서 선택된 두 가지 이상의 조합을 포함하는 위장관 운동 장애 질환의 예방 또는 치료용 약학 조성물 및 위장관 운동 장애 질환의 예방 또는 개선을 위한 건강기능식품용 조성물을 제공한다.본 발명에 따른 조성물은 시호, 황련 및 감초 중 두 가지 이상의 조합을 포함하고, 위장관의 운동, 특히 위배출률 및 장관 수송능을 유의적으로 촉진함으로써 위장관 운동장애 질환, 특히 위배출율 또는 장관 수송능과 관련된 기능성 소화불량증의 예방, 개선 또는 치료에 유용하다. 또한, 본 발명에 따른 조성물은 천연 물질로 이루어져 인체에 독성이 거의 없어 바람직하다.