The present invention relates to a pharmaceutical oral formulation for use in the administration of at least two bacteria derived from fecal microbiota to mammals for the treatment and/or prevention of dysbiosis and associated pathologies. The pharmaceutical oral formulation is encapsulated mixture of at least two bacteria derived from fecal microbiota wherein the capsules are coated in a pH responsive polymer composition comprising: a. 60-70% poly(methyl acrylate-co-methyl methacrylate-co-methacrylic acid) 7:3:1 by weight of dry polymer, b. 10-20% poly(methacrylic acid-co-ethyl acrylate) 1:1 by weight of dry polymer, c. at least one fatty acid mono-, di- or tri- glyceride ester, or mixtures thereof, d. at least one plasticizer, e. at least one non-ionic emulsifier. The pharmaceutical oral formulation is especially designed to be delivered principally in the ileum and colon and to maintain the sample bacterial viability and diversity.La présente invention concerne une formulation pharmaceutique orale destinée à être utilisée pour administrer à des mammifères au moins deux bactéries issues d'un microbiote fécal pour le traitement et/ou la prévention de la dysbiose et de pathologies associées. La formulation pharmaceutique orale est un mélange encapsulé d'au moins deux bactéries issues du microbiote fécal, les capsules étant enrobées dans une composition polymère sensible au pH comprenant : a. 50 à 70 % d'acide de polyméthylacrylate-co-méthyl-méthacrylate -co-méthacrylique dans un rapport de 7 : 3 : 1 en poids de polymère sec, b. 10 à 30 % d'acide polyméthacrylique-co-éthyl acrylate dans un rapport de 1 : 1 en poids de polymère sec, c. au moins un ester d'acide gras mono-, di- ou tri-glycéride, ou des mélanges de ceux-ci, d. au moins un plastifiant, e. au moins un émulsifiant non ionique. La formulation pharmaceutique orale est spécialement conçue pour être administrée principalement dans l'iléon et le côlon et pour maintenir la viabilité et la diversité ba
