The present invention relates to a pharmaceutical composition and food composition for preventing or treating gastro-intestinal motility disorders, and more specifically, to a pharmaceutical composition and food composition for effectively preventing or treating gastro-intestinal motility disorders using a fraction isolated from the extract of Chamaecyparis obtuse, and dihydrosesamin, hinokiflavone, savinin, and isocryptomerin compounds. The present invention can provide a pharmaceutical composition and food composition capable of preventing and treating gastro-intestinal motility disorders, such as functional dyspepsia or constipation, irritable bowel symptom, diabetic gastrointestinal motility disorders, gastrointestinal motility disorder caused by chemotherapy, ileus due to gut motility disorder, and myotonic dystrophy, by using a fraction isolated by adding an organic solvent to the extract of Chamaecyparis obtuse, or dihydrosesamin, hinokiflavone, savinin, or isocryptomerin.본 발명은 위장관 운동장애 예방 및 치료용 약학 조성물 및 식품 조성물에 관한 것으로서, 편백으로부터 추출한 분획물과 다이하이드로세사민, 히노키플라본, 사비닌, 이소크립토메린 화합물을 이용하여 위장관 운동장애 예방 및 치료에 효과적인 약학 조성물 및 식품 조성물에 관한 것이다. 본 발명은 편백추출물에 유기용매를 가해 분획한 분획물 또는 다이하이드로세사민, 히노키플라본, 사비닌, 이소크립토메린 화합물을 이용하여 기능성 소화불량이나 변비, 과민성 대장증상, 당뇨병성 위장운동장애, 화학요법으로 인한 위장운동장애, 소화관 운동장애로 인한 장폐색증, 근긴장성 이영양증 등의 위장관 운동 장애를 예방하고 치료할 수 있는 약학 조성물 및 식품 조성물을 제공할 수 있다.