To provide a capsule endoscope system and an information processing apparatus can generate the in-vivo image group along the path of the digestive tract. -Vivo image data, and is associated with said body in the image data, a storage unit 59 for storing the information related to the position of the capsule endoscope 2 within the object, the information processing apparatus, based on information related to the position Te, a position information acquisition unit 54 acquires position information of the capsule endoscope 2 during imaging of the in-vivo image, the correlation calculating unit on the basis of the in-vivo image data, and calculates the correlation of the in-vivo images between the predetermined and a replacement section 55 on the basis of the location information 56, obtained by the position information acquisition unit 54, and the degree of correlation calculated by the correlation calculating unit 56 interchanges the order of the in-vivo image.消化管の経路に沿った体内画像群を生成することができる情報処理装置及びカプセル型内視鏡システムを提供する。情報処理装置は、体内画像データと、該体内画像データに関連付けられ、被検体内におけるカプセル型内視鏡2の位置に関連する情報とを格納する記憶部59と、位置に関連する情報に基づいて、当該体内画像の撮像時におけるカプセル型内視鏡2の位置情報を取得する位置情報取得部54と、体内画像データに基づいて、所定の体内画像間の相関度を算出する相関度算出部56と、位置情報取得部54により取得された位置情報と、相関度算出部56により算出された相関度とに基づいて、体内画像の並び順を入れ替える入れ替え部55とを備える。
