The invention relates to a method for preparing a composition that is very rich in squalene produced by fermentation of micro-organisms. The method is characterized in that it comprises a purification step selected from the group including: supercritical CO2 extraction in a multi-stage counter-current fractionation column with extract reflux, and short-path molecular distillation.본 발명은 미생물유기체의 발효에 의해 생성된 스쿠알렌이 매우 풍부한 조성물의 제조방법에 관한 것이다. 본 방법은 추출 환류를 이용한 다단 역류 분별분리관 내 초임계 CO2 추출, 및 짧은 경로 분자 증류를 포함하는 군으로부터 선택되는 정제 단계를 포함하는 것을 특징으로 한다.