Method for producing a modified oligonucleotide, wherein at least one polymer, preferably polyalkylene oxide, and/or a compound is covalently bound to the 5′-end or the 3′-end of the oligonucleotide via native ligation forming a native ligation site, with the proviso that the polymer and/or the compound is not a protein or peptide, if only the 5′-end of the oligonucleotide is modified by binding of the polymer or compound via native ligation. The invention is further directed to a modified oligonucleotide obtainable by the inventive method as well as the use of such modified oligonucleotide for the preparation of a medicament for preventing and/or treating a tumor, formation of metastasis, an immune disease or disorder, a cardiovascular disease or disorder, and/or a viral disease or disorder.少なくとも1つのポリマー、好ましくはポリアルキレンオキシドと化合物との少なくとも一方又は両方を、ネイティブライゲーションによってオリゴヌクレオチドの5’末端または3’末端と共有結合してネイティブライゲーション部位を形成し、オリゴヌクレオチドの5’末端のみがネイティブライゲーションによるポリマーまたは化合物の結合によって修飾される場合、ポリマーおよび/または化合物はタンパク質でもペプチドでもない、修飾オリゴヌクレオチドを生成する方法である。本発明はさらに、本発明の方法によって得ることができる修飾オリゴヌクレオチド、ならびに腫瘍、転移の形成、免疫疾患もしくは障害、心血管病もしくは障害、および/またはウイルス性疾患もしくは障害を予防および/または処理するための医薬品を調製するためのそのような修飾オリゴヌクレオチドの使用に関する。