A method of fractionating a mannosylerythritol lipids (MELs) containing composition by loading the composition onto an adsorbing support, separating a fraction which is enriched in MELs from the support using supercritical carbon dioxide, and optionally separating one or more further fractions enriched in MELs from the support using supercritical carbon dioxide and an optional co-solvent. The MELs can be obtained at high concentration by using only “green” solvents.L'invention concerne un procédé de fractionnement d'une composition contenant des lipides du type mannosylérythritol (MEL), qui consiste à charger la composition sur un support adsorbant, à séparer une fraction qui est enrichie en MEL, à partir du support, à l'aide de dioxyde de carbone supercritique, et éventuellement à séparer une ou plusieurs autres fractions enrichies en MEL à partir du support à l'aide de dioxyde de carbone supercritique et d'un co-solvant facultatif. Les MEL peuvent être obtenus à concentration élevée à l'aide uniquement de solvants respectueux de l'environnement.