A method and a system for visually localizing brain functional structure in a craniotomy, the method comprising: before a craniotomy, acquiring a brain functional structure fusion image of a patient by means of functional structure imaging, and performing functional imaging on the brain functional structure fusion image of the patient according to a pre-determined imaging scheme, so as to acquire a functional image to be registered in the craniotomy, acquiring a brain optical image of the patient by means of an optical device, and performing area segmentation on the brain optical image of the patient, so as to acquire an optical image to be registered and matching the functional image to be registered with the optical image to be registered so as to acquire an optical and functional calibration image.Linvention concerne un procédé et un système visant à localiser visuellement une structure fonctionnelle cérébrale lors dune craniotomie, le procédé consistant à : avant une craniotomie, acquérir une image de fusion dune structure fonctionnelle cérébrale dun patient par imagerie de la structure fonctionnelle, et réaliser une imagerie fonctionnelle sur limage de fusion de la structure fonctionnelle cérébrale du patient selon un schéma dimagerie prédéterminé, de façon à acquérir une image fonctionnelle à enregistrer lors de la craniotomie, acquérir une image optique du cerveau du patient au moyen dun dispositif optique, et effectuer une segmentation de zone sur limage optique du cerveau du patient de façon à acquérir une image optique à enregistrer et mettre en correspondance limage fonctionnelle à enregistrer avec limage optique à enregistrer de façon à acquérir une image détalonnage optique et fonctionnelle.