Create a picture of a particular portion of the vivid image. The imaging apparatus according to the present embodiment is based on a light detecting part for detecting a second light obtained by irradiating a sample with a first light, an infrared light obtained by irradiating an infrared ray with a sample, and generating a original image from the detected infrared light, and based on the light emitting position and the original image in the sample of the second light detected A control unit for generating a sample image is provided (see Fig. 1).鮮明な、サンプルの特定部分の画像を生成する。本実施形態による撮像装置は、サンプルに第1光を照射して得られる第2光と、サンプルに赤外光を照射して得られる赤外光とを検出する光検出部と、検出した赤外光から元画像を生成し、検出した第2光の前記サンプルにおける発光位置と元画像とに基づいてサンプル画像を生成する制御部と、を備える(図1参照)。