The present invention is a method for performing site-specific modification in a plant by transient expression of a gene, comprising the following: The sequence-specific nuclease is specific to a target site, and the target site is cleaved by the nuclease, so that site-specific modification of the target site is achieved by DNA repair of the plant. Provide a method to be achieved.本発明は、遺伝子の一過性発現により植物において部位特異的改変を行うための方法であって、以下:対象の植物の細胞または組織において標的断片に特異的な配列特異的ヌクレアーゼを一過的に発現させるステップを含み、前記配列特異的ヌクレアーゼが標的部位に特異的であり、かつ前記標的部位が前記ヌクレアーゼにより切断され、その結果、前記植物のDNA修復により前記標的部位の部位特異的改変が達成される方法を提供する。