A nanocomplex, of particle size 50 nm to 1000 nm, containing saporin and a lipid-like compound, in which saporin binds to the lipid-like compound via non-covalent interaction or covalent bonding. The lipid-like compound has a hydrophilic moiety, a hydrophobic moiety, and a linker joining the hydrophilic moiety and the hydrophobic moiety. The hydrophilic moiety is optionally charged and the hydrophobic moiety has 8 to 24 carbon atoms. Also disclosed is a pharmaceutical composition containing such a nanocomplex and a pharmaceutically acceptable carrier. The nanocomplex is useful in treating diseases, such as cancer.Un nanocomplexe possédant une taille de particules de 50 nm à 1000 nm contient de la saporine et un composé de type lipidique, la saporine se liant au composé de type lipidique par interaction non covalente ou par liaison covalente. Le composé de type lipidique comporte une fraction hydrophobe, une fraction hydrophile et un liant reliant les fragments hydrophile et hydrophobe. La fraction hydrophile est éventuellement chargée, et la fraction hydrophobe possède de 8 à 24 atomes de carbone. L'invention concerne également une composition pharmaceutique contenant ce nanocomplexe et un excipient pharmaceutiquement acceptable. Le nanocomplexe est utile dans le traitement de maladies telles que le cancer.