本发明公开了一种爪哇根结线虫效应基因Mj-1-1,相关蛋白及应用。该效应基因Mj-1-1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1~3所示,其相关蛋白MJ-1-1的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。本发明证明了基因Mj-1-1在爪哇根结线虫的寄生中发挥重要作用,本发明还成功构建了RNAi植物表达载体,转化农杆菌EHA105后,通过烟草组织培养的方法将该载体转入植物,在植物中产生Mj-1-1的dsRNA,该植株能显著抑制根结线虫的寄生,获得了良好的抗根结线虫植物。本发明为根结线虫的防治提供了新靶标,对实践中培育抗根结线虫作物具有很好的理论和指导意义。