Ein erfindungsgemäßes System zum Sterilisieren von medizinischen Instrumenten (1), weist auf:- eine Prüfstation (20-26) zum Prüfen angelieferter Instrumente;- ein Instrumentenlager (40) zum Zwischenlagern geprüfter Instrumente;- eine Packstation (70) zum Bestücken von Instrumententrägern (2) mit Instrumenten aus dem Instrumentenlager;- wenigstens einen Roboter (30) zum Transportieren von Instrumenten von der Prüfstation zu dem Instrumentenlager und/oder zum Bestücken von Instrumententrägern an der Packstation mit Instrumenten von dem Instrumentenlager, insbesondere auf Basis eines operationsspezifisch vorgegebenen Packmusters; und- eine Sterilisiervorrichtung (91, 92) zum Sterilisieren von mit Instrumenten bestückten Instrumententrägern von der Packstation.A system according to the invention for sterilizing medical instruments (1) has: - a test station (20-26) for testing delivered instruments; - an instrument store (40) for temporarily storing tested instruments; - a packing station (70) for equipping instrument carriers ( 2) with instruments from the instrument store; - at least one robot (30) for transporting instruments from the test station to the instrument store and / or for loading instrument racks at the packing station with instruments from the instrument store, in particular on the basis of an operation-specific predetermined packing pattern; and - a sterilizing device (91, 92) for sterilizing instrument carriers equipped with instruments from the packing station.