The present invention relates to methods and compositions for modulating gastrointestinal microflora of a canine. In one embodiment, a method of modulating gastrointestinal microflora in a canine can comprise administering to the canine a pet food composition comprising from about 25% to about 60% protein, from about 5% to about 30% carbohydrates, fat, and fiber; where after administration, the Bacteroidetes to Firmicutes (B/F) ratio of the canine is less than 0.8.La présente invention concerne des procédés et des compositions pour moduler la microflore gastro-intestinale d'un canin. Dans un mode de réalisation, un procédé de modulation de la microflore gastro-intestinale chez un canin peut comprendre l'administration au canin d'une composition alimentaire pour animaux de compagnie comprenant d'environ 25 % à environ 60 % de protéine, d'environ 5 % à environ 30 % de glucides, de graisse et de fibre, après laquelle administration, le rapport Bacteroidetes à Firmicutes (B/F) du canin est inférieur à 0,8.