Method for quantitative flow analysis of a tree of conduits perfusing an organ from at least two bi-dimensional images, the method comprising the following steps: a) making a 3D reconstruction of at least part of the tree from said at least two bi-dimensional images; b) identifying a segment of interest within the 3D reconstruction; c) making geometric calculations based on the 3D reconstruction; d) receiving from a user input on a model to be considered for the flow analysis and on the location of the segment of interest within such model; e) elaborating the model into a multi-scale functional model of the tree flow; f) scaling the part of the functional model related to the segment of interest using geometrical features of the 3D reconstruction; g) performing quantitative image analysis to correct the functional model to take into account of the status of at least parts of the conduits forming the tree; h) performing quantitative flow analysis based on the functional model so obtained. A corresponding apparatus and computer program are also disclosed.L'invention concerne un procédé d'analyse de flux quantitative d'un arbre de conduits perfusant un organe à partir d'au moins deux images bi-dimensionnelles, le procédé comprenant les étapes suivantes consistant : a) à réaliser une reconstruction en 3D d'au moins une partie de l'arbre depuis lesdites deux images bi-dimensionnelles ; b) à identifier un segment d'intérêt au sein de la reconstruction 3D soit automatiquement ou semi-automatiquement lors de l'entrée utilisateur ; c) à effectuer des calculs sur la base de la reconstruction en 3D pour déterminer les caractéristiques géométriques des conduits tels que des diamètres, longueurs, courbures, axes médians, ou similaire(s) ; d) à recevoir une indication en provenance de l'utilisateur pour entrer un modèle fonctionnel multi-échelle de l'arbre de façon à être pris en considération pour l'analyse de flux et pour entrer l'emplacement du segment d'intér