PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method of generating an image output model capable of improving the usefulness of information provided in diagnosing a disease or the like. A method for generating an image output model is such that a model for inputting morphological image data KPDi and outputting pseudo substance image data including an image portion regarding a distribution of a target substance in a part of a body of a subject is a real substance part. A model generation step of generating an image output model by modifying based on the image data BPDi is included. [Selection diagram] Figure 4【課題】疾病等の診断にあたって提供される情報の有用性の向上を図ることができる画像出力モデルの生成方法を提供する。【解決手段】画像出力モデルの生成方法は、形態画像データKPDiを入力し、被験者の体内における一部の部位における対象物質の分布に関する画像部分を含む疑似物質画像データを出力するモデルを実物質部分画像データBPDiに基づいて修正することにより、画像出力モデルを生成するモデル生成ステップを含む。【選択図】図4