Provided are methods and compositions for inhibiting MASP-3-dependent complement activation in a subject suffering from paroxysmal nocturnal hemoglobinuria by administering to the subject a composition comprising an amount of a MASP-3 inhibitory agent in an amount effective to inhibit MAS P-3-depencien! complement activation. Also provided are methods and compositions for increasing the survival of red blood cells in a subject suffering from paroxysmal nocturnal hemoglobinuria by administering to the subject a composition comprising an amount of at least one of a MASP-1 inhibitory agent and/or a MAS P-3 inhibitory agent effective to increase the survival of red blood cells. The subject may be administered a MASP-2 inhibitory agent and a MASP-1 inhibitory agent, a MASP-2 inhibitory agent and a MASP-3 inhibitory agent, administered, a MASP-3 inhibitory agent and a MASP-1 inhibitory agent, or a MASP-1 inhibitory agent, a MASP-2 inhibitory agent and a MASP-3 inhibitory agent.En un aspecto, la invención proporciona métodos y composiciones para inhibir la activación del complemento dependiente de MASP-3 en un sujeto que padece de hemoglobinuria paroxística nocturna mediante la administración al sujeto de una composición que comprende una cantidad de un agente inhibidor de MASP-3 en una cantidad eficaz para inhibir la activación del complemento dependiente de MASP-3. En otro aspecto, la invención proporciona métodos y composiciones para aumentar la supervivencia de los glóbulos rojos en un sujeto que padece de hemoblobinuria paroxística nocturna mediante la administración al sujeto de una composición que comprende una cantidad de al menos uno de un agente inhibidor de MASP-1 y/o un agente inhbidor de MASP-3 eficaz para aumentar la supervivencia de los glóbulos rojos. En algunas modalidades, se le administra al sujeto un agente inhibidor de MASP-2 y un agente inhibidor de MASP-1, un agente inhibidor de MASP-2 y un agente inhibidor de MASP-3, un agente inhbidor de MASP-3 y u