The present invention relates to microvesicles derived from a protoplast which is a bacterial, arhaea, fungal or plant cell or the like from which a cell wall is removed. The microvesicles derived from a protoplast of the present invention enables free loading of a material necessary for diagnosis, treatment, vaccine, target induction, cell membrane fusion with a target cell, reduction of in vivo and in vitro side effects, stability improvement, and the like, and allows the therapeutic material, the diagnostic material and/or the vaccine material to be delivered specifically to a specific tissue or cell.본 발명은 세균, 고세균, 곰팡이, 식물세포 등에서 세포벽을 제거한 원형질체에서 유래한 마이크로베시클에 관한 것이다. 본 발명의 원형질체 유래 마이크로베시클은 진단, 치료, 백신, 표적유도, 표적세포와의 세포막융합 및 생체 내외에서의 부작용 감소와 안정성 증진 등의 목적으로 필요한 물질을 자유롭게 로딩하는 것이 가능하며, 상기 치료용 물질, 진단용 물질, 및/또는 백신용 물질을 특정 조직이나 세포에 특이적으로 전달하는 것을 가능하게 한다.