Biomarkers associated with inflammatory bowel disease (IBD) are provided, as well as methods of using such biomarkers for diagnosing, assessing and monitoring disease progression. The biomarkers may be measured at the protein level or the gene expression level Biomarkers may be tracked individually or in groups of two or more. The disclosed biomarkers may find particular utility in monitoring a course of therapy, such as treatment with an IL-23 antagonist. Changes in biomarker levels can also be used to confirm target engagement and therapeutic efficacy. Changes in biomarkers can also be used inform modification of a therapeutic regimen, for example to increase or decrease dosing of a therapeutic agent, such as an anti-IL-23 or anti-IL-23R anti-body.炎症性腸疾患(IBD)に関連した生物マーカー、ならびに疾患の診断、評価および疾患の進行のモニターのためのそのような生物マーカーの使用方法を提供する。該生物マーカーはタンパク質レベルまたは遺伝子発現レベルで測定されうる。生物マーカーは個別に又は2以上の群として追跡されうる。開示されている生物マーカーは、IL-23アンタゴニストでの治療のような療法の経過のモニターにおいて特に有用でありうる。生物マーカーレベルの変化は、標的関与および治療効力を確認するためにも用いられうる。生物マーカーの変化は、治療計画の変更、例えば抗IL-23または抗IL-23R抗体のような治療用物質の投与量の増加または減少を知らせる場合にも用いられうる。