An image acquisition unit for obtaining three-dimensional image data including a moving organ, an image display unit for displaying a three-dimensional image of the three-dimensional image data, the medical image processing apparatus of the present invention, is displayed on the image display unit Diagnosis and measurement target setting section for setting a measurement target of the desired three-dimensional image, the displacement amount calculated in each time phase displacement of the three-dimensional image data for the target object in the desired, is calculated in each time phase I includes a diagnostic index calculator for calculating an index, and a control unit for controlling the display on the image display unit and the diagnostic indicator.本発明の医用画像処理装置は、運動臓器を含む3次元画像データを取得する画像取得部と、前記3次元画像データを3次元画像として表示する画像表示部と、前記画像表示部に表示された3次元画像に所望の計測対象を設定する計測対象設定部と、前記所望の計測対象について前記3次元画像データの変位量を時相毎に演算し、時相毎に演算された変位量により診断指標を演算する診断指標演算部と、前記診断指標を前記画像表示部に表示制御する制御部と、を備える。