本发明涉及一种超嗜热糖苷酶突变体及其在人参皂苷CK制备中的应用,属于生物技术工程技术领域。超嗜热糖苷酶突变体的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所述,超嗜热糖苷酶突变体在制备稀有人参皂苷CK的应用。超嗜热糖苷酶突变体,具有很高的耐热性和稳定性,在70℃‑80℃下保温300小时以上仍能保持较高催化活力,因而运用到生产中,具有储运成本低,加快动力学反应,对反应器冷却系统要求标准低等优点。同时,具有β‑葡萄糖苷酶活性,并且可以在不破坏皂苷结构的基础上,水解主要二醇型人参皂苷C3位和C20位的葡萄糖苷生成稀有人参皂苷Compound K,具有高效、专一、副产物少、产率高等优点,因而可将Fpglu1a应用到稀有人参皂苷Compound K的工业生产中。