The methods and compositions described herein relate to the delivery of polypeptides to a target cell, e.g. by utilizing engineered non-pathogenic bacteria comprising a type three secretion system (T3SS) and T3SS-compatible substrates. In one aspect, described herein are non-pathogenic microbial cells that have been engineered to express both a functional type three secretion system (T3SS) and at least one polypeptide that is compatible with the T3SS. Due to the wide variety of polypeptides that can be delivered to a target eukaryotic cell using the compositions and systems described herein, a commensurately wide variety of applications is contemplated, e.g. therapeutics and reprogramming.Les procédés et les compositions décrits ici concernent la délivrance de polypeptides à une cellule cible, par exemple au moyen de bactéries non pathogènes manipulées comprenant un système de sécrétion de type trois (T3SS) et des substrats compatibles avec le T3SS. Dans un aspect, l'invention concerne des cellules microbiennes non pathogènes qui ont été manipulées pour exprimer un système de sécrétion type trois (T3SS) fonctionnel et au moins un polypeptide qui est compatible avec le T3SS. Grâce à la grande diversité des polypeptides qui peuvent être délivrés à une cellule eucaryote cible au moyen des compositions et des systèmes de l'invention, des applications d'une diversité innombrable sont envisagées, par exemple en thérapeutique et en reprogrammation.