PURPOSE: An apparatus for scratching funguses for an automatic system for cultivating mushroom is provided to increase productivity due to effective mushroom growth. CONSTITUTION: An apparatus for scratching funguses for an automatic system for cultivating mushroom comprises a bottle transfer unit(10) moved along one side in which the bottom of bottles is contained a cage; a lid opening(20); a funguses scratching unit(30); and a unit for tuning upside down bottles in the state where the opening of the bottles is downwardly directed.본 발명에 따른 자동화 버섯 재배 시스템의 균긁기는 병들의 입구가 뚜껑들로 막힌 상태에서 병들의 바닥이 바구니에 담겨져 일방향을 따라 이동되는 병 이동수단; 병 이동수단에 설치되고, 바구니에 담겨진 병들의 입구가 상향된 상태에서 뚜껑을 한꺼번에 개방시키는 뚜껑 개방부; 병 이동수단에 설치되고, 뚜껑 개방부에서 뚜껑이 개방된 후에 병들의 입구가 하향된 상태에서 노화균을 긁어내는 균 긁기부; 그리고, 병 이동수단에 설치되고, 균 긁기부에서 균긁기가 이뤄진 후에 병들의 입구가 하향된 상태에서 바구니에 담겨지는 병 뒤집기부;를 포함하기 때문에 균긁기 작업을 자동화하여 작업 효율 및 생산성을 높일 수 있다.