本发明涉及基因工程领域,具体地,本发明涉及优化的β-甘露聚糖酶基因MAN及其毕赤酵母表达载体。本申请对核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的β-甘露聚糖酶基因进行改造,得到优化基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。构建了优化β-甘露聚糖酶基因的重组毕赤酵母表达载体并将其转化到毕赤酵母感受态细胞X33中筛选得到高效表达β-甘露聚糖酶的转β-甘露聚糖酶毕赤酵母菌株;酶学性质测定表明,优化的β-甘露聚糖酶基因能在毕赤酵母中稳定、高效的表达及遗传,所表达的β-甘露聚糖酶酶活性以及稳定性显著高于原始β-甘露聚糖酶基因毕赤酵母中所表达的β-甘露聚糖酶的酶活性及稳定性。