Methods and systems (10, 54, 72) are provided for administering phototherapy to an injured tissue in a living subject by delivering visible or infrared biostimulatory energy to bone marrow at a dose sufficient to cause mesenchymal stem cells to appear in the injured tissue. The energy may be coherent light and can be administered transcutaneously, subcutaneously, or via an intramedullary probe (74). The technique is useful for treating many types of tissue injury, including ischemic cardiac and renal conditions.L'invention concerne des procédés et des systèmes (10, 54, 72) pour administrer une photothérapie sur un tissu lésé d'un patient vivant par distribution d'énergie biostimulante visible ou infrarouge dans la moelle osseuse, à une dose suffisante pour faire apparaître des cellules souches mésenchymateuses dans le tissu lésé. L'énergie peut être une lumière cohérente et peut être administrée de manière transcutanée, sous-cutanée, ou par l'intermédiaire d'une sonde intramédullaire (74). La technique selon l'invention est utile pour traiter plusieurs types de lésion tissulaire, notamment des troubles ischémiques cardiaques et rénaux.