To provide a three-dimensional image processing system, a method, and a program which can generate an image which has left a clear feature so that positioning processing with an endoscopic image is possible by high-speed processing.SOLUTION: A three-dimensional image processing system includes: a three-dimensional image acquisition unit 11 which acquires a three-dimensional image obtained by photographing a subject； a graph structure generation unit 12 generating a graph structure of a tubular structure included in a three-dimensional image； a contour information acquisition unit 13 acquiring contour information of the tubular structure in each point on the graph structure； a viewpoint information acquisition unit 14 acquiring viewpoint information in the tubular structure； a projection point identifying unit 15 identifying a projection point from respective points on the graph structure on the basis of viewpoint information and the graph structure； and a projection image generation unit 16 generating a projection image projecting the contour information of the projection point onto a two-dimensional plane.SELECTED DRAWING: Figure 1【課題】内視鏡画像との位置合わせ処理が可能なように端的な特徴を残した画像を高速な処理によって生成可能な３次元画像処理装置および方法並びにプログラムを提供する。【解決手段】被検体を撮影して得られた３次元画像を取得する３次元画像取得部１１と、３次元画像に含まれる管状構造物のグラフ構造を生成するグラフ構造生成部１２と、グラフ構造上の各点における管状構造物の輪郭情報を取得する輪郭情報取得部１３と、管状構造物内における視点情報を取得する視点情報取得部１４と、視点情報とグラフ構造とに基づいて、グラフ構造上の各点の中から投影点を特定する投影点特定部１５と、投影点の輪郭情報を２次元平面上に投影した投影画像を生成する投影画像生成部１６とを備える。【選択図】図１
